Recherche Le génome complet du genre Rosa est décrypté

Quarante scientifiques du monde entier, coordonnés depuis Angers (49) par l'Institut de recherche en horticulture et semences, ont travaillé sur ce dossier...

«L'obtention de ce génome est une très grande fierté pour notre laboratoire et pour la région des Pays de la Loire qui l'a soutenu », a réagi Jean-Pierre Renou, directeur de l'Institut de recherche en horticulture et semences (IRHS) le 20 juin, en conférence de presse, à Angers (49). Une fierté affirmée et partagée avec l'équipe de 40 chercheurs - des Français mais également des Allemands, des Belges, des Néerlandais, des Russes et des Japonais - qui, depuis plusieurs années, travaillent sur le séquençage du génome du rosier. En l'occurrence Rosa chinensis ‘Old Blush' distingué pour son caractère diploïde « mais également parce que cette variété d'origine chinoise, très ancienne a été utilisée partout dans le monde et est à l'origine de nombreuses roses modernes », a expliqué Laurence Hibrand-Saint Oyant (IRHS), spécialiste de la transmission des caractères du rosier rappelant au passage « que l'on doit en particulier à ‘Old Blush', le caractère remontant et la couleur jaune ».

Accélérer le travail de sélection variétale L'idée de séquencer le génome du rosier a presque 20 ans. Pour qu'elle aboutisse, les chercheurs ont dû attendre que les techniques de séquençage progressent et trouver le financement ad hoc. Publié le 11 juin 2018 dans la revue scientifique Nature Plants, le résultat de leur travail est un séquençage d'une très grande qualité. « En s'appuyant sur une carte génétique à haute densité de marqueurs moléculaires, le génome a pu être assemblé en 7 pseudo-molécules représentant les 7 chromosomes du rosier. D'une taille totale de 512 Mpb (millions de paires de bases), assemblées en 551 fragments, ce génome comporterait 44 481 gènes », détaille le communiqué de l'IRHS.Sur le plan de la recherche appliquée, l'identification des gènes, notamment ceux responsables du nombre de pétales et de la densité des épines, va permettre « d'accélérer le travail de sélection variétale », pointe Fabrice Foucher, responsable de l'équipe IRHS « Génétique et diversité des plantes ornementales » et coordinateur de l'équipe internationale.

Étudier la résistance aux maladies À Angers (49), la résistance aux maladies est également au centre de toutes les attentions. Dans le prolongement du séquençage, deux études complémentaires sont en cours. L'une est menée par l'IRHS, qui dispose d'une roseraie remarquable avec près de 2 000 génotypes différents - dont une population de 1 000 descendants issue de croisements de Rosa chinensis ‘Old Blush' x Rosa wichurana. Elle vise à déterminer quels gènes sont impliqués dans la résistance aux maladies, en particulier celle des taches noires. L'autre étude, entre les mains de l'université d'Angers, s'intéresse aux rosiers sauvages « avec l'objectif », précise Jérémy Clotault, enseignant-chercheur « d'identifier de nouvelles sources de résistance ».

Légende photo : L'obtention du génome de Rosa chinensis ‘Old Blush' va permettre d'accélérer le travail des sélectionneurs. De gauche à droite : Latifa Hamama (IRHS), Laurence Hibrand-Saint Oyant (IRHS), Fabrice Foucher (IRHS) et Jérémy Clotault (université d'Angers).

Anne Mabire